Ang pangunahing pagtuklas, na inilalarawan online ngayong linggo sa Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS), ay nasa isang bagong tool na binuo nina Propesor Sabrina Leslie at W alter Reisner ng McGill's Physics Department at kanilang collaborator na si Dr. Rob Sladek ng Génome Québec Innovation Center. Binibigyang-daan nito ang mga mananaliksik na i-load ang mga mahahabang hibla ng DNA sa isang tunable na nanoscale imaging chamber sa mga paraan na nagpapanatili ng kanilang pagkakakilanlan sa istruktura at sa ilalim ng mga kondisyong katulad ng matatagpuan sa katawan ng tao.
Ang bagong binuong "Convex Lens-Induced Confinement" (CLIC) na ito ay magpapahintulot sa mga mananaliksik na mabilis na mag-map ng malalaking genome habang malinaw na tinutukoy ang mga partikular na sequence ng gene mula sa mga solong cell na may solong molekula na resolusyon, isang proseso na kritikal sa pag-diagnose ng mga sakit tulad ng cancer.
Ang CLIC, ang bagong tool, ay maaaring umupo sa ibabaw ng isang karaniwang inverted fluorescence microscope na ginagamit sa laboratoryo ng unibersidad. Ang makabagong aspeto ng CLIC ay nakasalalay sa katotohanan na pinapayagan nito ang mga hibla ng DNA na mai-load sa silid ng imaging mula sa itaas, isang proseso na nagpapahintulot sa mga hibla ng DNA na mapanatili ang kanilang integridad. Ang mga umiiral nang tool na ginagamit para sa genomic analysis ay umaasa sa side-loading na DNA sa ilalim ng pressure sa mga nanochannel sa imaging chamber, isang kasanayang hinahati-hati ang mga molekula ng DNA sa maliliit na piraso, na ginagawang isang hamon na muling buuin ang genome.
"Ito ay tulad ng pagpiga ng maraming malambot na spaghetti noodles sa mahabang makitid na tubo nang hindi nasira ang mga ito," paliwanag ni Prof. Leslie habang inilalarawan niya kung ano ang pakiramdam ng paggamit ng CLIC. "Kapag ang mga mahahabang hibla ng DNA na ito ay dahan-dahang napipisil pababa sa mga nanochannel mula sa isang nanoscale bath sa itaas, sila ay magiging epektibong matibay na nangangahulugan na maaari nating imapa ang mga posisyon sa magkatulad na nakaunat na mga hibla ng DNA, habang pinipigilan ang mga ito. Nangangahulugan ito na ang mga diagnostic ay maaaring maisagawa nang mabilis, isang cell sa isang pagkakataon, na mahalaga para sa pag-diagnose ng maraming kundisyon bago ang panganganak at ang pagsisimula ng cancer."
"Karaniwang nangangailangan ng sampu-sampung libong cell na halaga ng genomic material ang kasalukuyang mga kasanayan ng genomic analysis upang makuha ang impormasyong kailangan namin, ngunit gumagana ang bagong diskarte na ito sa mga single cell," sabi ni Dr. Rob Sladek ng Génome Québec Innovation Center. "Bibigyang-daan ng CLIC ang mga mananaliksik na maiwasan ang paggugol ng oras sa pagsasama-sama ng mga mapa ng buong genome gaya ng ginagawa natin sa ilalim ng mga kasalukuyang pamamaraan, at nangangako na gawing mas simple at mas mahusay na proseso ang pagsusuri ng genomic."
"Napakaraming maiaalok ng nanoscale physics ng biomedicine at diagnostics," dagdag ni Prof. Leslie. "Dinadala ng CLIC ang nanoscale regime sa bench top, at ang genomics ay simula pa lamang."
